Badania wykonywane na materiale z bloczków parafinowych w Pracowni Biologii Molekularnej | |
Badanie FISH | Sonda |
Rearanżacja genu BCL2 | Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ |
Rearanżacja genu BCL6 | |
Rearanżacja genu MYC | |
Rearanżacja genu MALT1 | |
Rearanżacja genu SS18 | |
Rearanżacja genu FOXF1 | |
Rearanżacja genu DDIT3 | |
Rearanżacja genu EWSR1 | |
Rearanżacja genu CCND1 | |
Amplifikacja genu HER-2 | |
Amplifikacja genu MDM2 | |
Fuzja genów IGH/CCND1 | |
Fuzja genów COL1A1/PDGFB | |
Kodelecja 1p/19q | |
Genotypowanie | Metoda |
Detekcja wirusa HPV (wykrywane typy: 6, 11, 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 66, 68, 70, 73, 82) | PCR w czasie rzeczywistym (test CE IVD) |
Analiza mutacji w genach | Metoda |
Analiza mutacji w eksonach 2, 3 i 4 genu KRAS (kodony 12, 13, 59, 61, 117 i 146) |
PCR w czasie rzeczywistym (test CE IVD) |
Analiza mutacji w kodonie 600 genu BRAF | |
Analiza mutacji w eksonach 2, 3 i 4 genu NRAS (kodony 12, 13, 59, 61, 117 i 146) oraz w kodonie 600 genu BRAF | |
Analiza mutacji w eksonach 2, 3 i 4 genów KRAS i NRAS (kodony 12, 13, 59, 61, 117 i 146) oraz w kodonie 600 genu BRAF | |
Badanie niestabilności mikrosatelitarnej | PCR z analizą topnienia w wysokiej rozdzielczości |
Analiza mutacji w eksonach 9, 11, 13 i 17 genu KIT | Sekwencjonowanie DNA |
Analiza mutacji w eksonach 12, 14 i 18 genu PDGFRA | |
Analiza mutacji w eksonach 9, 11, 13 i 17 genu KIT oraz w eksonach 12, 14 i 18 genu PDGFRA |
|
Analiza mutacji Asp842Val w genie PDGFRA | |
Analiza mutacji Asp842Val w genie PIK3CA (kodony 420, 542, 545, 546, 1047) |
|
Analiza mutacji w genie IDH1 (kodon 132) | |
Analiza mutacji w genie IDH1 (kodon 132) i IDH2 (kodon 172) | |
Analiza mutacji w genie POLE – ekson 9 (P286R, M295R, S297F), ekson 11 (F367S, D368Y), ekson 13 (V411L, L424I, P436R, M444K), ekson 14 (A456P, S459F) |